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10x Genomics单细胞测序

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单细胞转录组测序利用 GemCode™技术的微流控技术进行单个细胞分选,将带有条形码和引物的凝胶珠和单个细胞包裹在油滴中;在每个油滴内,凝胶珠溶解,细胞裂解释放mRNA,通过逆转录产生用于测序的带条形码的cDNA;液体油层破坏后,cDNA后续进行文库构建,结合Illumina测序平台对文库进行测序检测,即可一次性获得大量单细胞的基因表达数据,从而达到在单细胞水平进行表达测序的目的。10× GenomicsChromium Single Cell单细胞测序技术的发展,极大地促进了单细胞组学研究。

技术特点:

·  超高的捕获效率(单个细胞捕获效率65%

·  全自动真正单细胞分离、实验周期短

·  超高的细胞通量(每个样本最多可测10000个细胞)

·  超低的单个细胞价格

·  通量高(可同时检测8个样本)

应用层面:

·  单细胞转录组:单细胞转录组测序使人们能够对异质群体中的细胞亚群进行全面的研究,追踪单个细胞的表达谱,鉴定稀有细胞类型。有效地解决组织样本无法破解的细胞异质性难题。

·  单细胞基因组(CNV):单细胞基因组测序能够检测单细胞水平的CNV,适合肿瘤研究。

· 单细胞免疫组库:单细胞免疫组库测序解决了TCR/BCR双链匹配的问题,可以在单细胞水平完美匹配TCR/BCR双链。

· 单细胞ATAC-seq:在单细胞层面利用改造后活性极高的转座酶切割开放染色质区域,对此区域进行测序,是转录调控机制研究领域的一种高效、简便的方法。


样本准备要求:

·  细胞数量与浓度:细胞起始数量大于1x105;浓度 5x105-1.2x106 /ml

·  细胞活性:活细胞数量在90%以上;

·  细胞大小:细胞直径小于40 μm

·  组织需要解离成单细胞悬液;

· 植物细胞需要制成原生质体;

·  细胞培养基及缓冲液不能含有Ca2+Mg2+等影响酶活性的物质。

单位介绍

  •        上海生物芯片有限公司(http://www.shbiochip.com, 简称SBC)是由国家发改委批准建立的生物芯片国家工程研究中心之一,通过六年的建设,已建立了基因表达谱芯片,基因分型, 蛋白与抗体,组织库与组织芯片和生物信息学等技术平台,是国家“863”计划生物芯片专项的主要承担者之一。 SBC凭借高标准的技术平台和多样性的产品等竞争优势,向同行业和相关单位提供系统的生物学研究全面解决方案,国内用户单位超过500家,地域遍及全国20多个省市,广泛应用于功能基因组、疾病基因组、药物基因组、中药现代化、农业生物技术、生态环境等各个领域,促进生物芯片对传统产业的渗透,加速生物芯片产业化发展。同时,公司还积极开拓国际市场,为全球各大药物研发机构提供技术服务,已与默克等六家大的药厂签订了合作协议。公司建立了严格的质量管理体系,通过了ISO9001认证,建立了GLP实验室,我们将秉承“质量为先”的原则,为国内外科研工作者提供高质量和系统全面的优质服务。

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上海市基因芯片专业技术服务平台

机构介绍:

       上海生物芯片有限公司(http://www.shbiochip.com, 简称SBC)是由国家发改委批准建立的生物芯片国家工程研究中心之一,通过六年的建设,已建立了基因表达谱芯片,基因分型, 蛋白与抗体,组织库与组织芯片和生物信息学等技术平台,是国家“863”计划生物芯片专项的主要承担者之一。 SBC凭借高标准的技术平台和多样性的产品等竞争优势,向同行业和相关单位提供系统的生物学研究全面解决方案,国内用户单位超过500家,地域遍及全国20多个省市,广泛应用于功能基因组、疾病基因组、药物基因组、中药现代化、农业生物技术、生态环境等各个领域,促进生物芯片对传统产业的渗透,加速生物芯片产业化发展。同时,公司还积极开拓国际市场,为全球各大药物研发机构提供技术服务,已与默克等六家大的药厂签订了合作协议。公司建立了严格的质量管理体系,通过了ISO9001认证,建立了GLP实验室,我们将秉承“质量为先”的原则,为国内外科研工作者提供高质量和系统全面的优质服务。

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