单细胞转录组测序利用 GemCode™技术的微流控技术进行单个细胞分选，将带有条形码和引物的凝胶珠和单个细胞包裹在油滴中；在每个油滴内，凝胶珠溶解，细胞裂解释放mRNA，通过逆转录产生用于测序的带条形码的cDNA；液体油层破坏后，cDNA后续进行文库构建，结合Illumina测序平台对文库进行测序检测，即可一次性获得大量单细胞的基因表达数据，从而达到在单细胞水平进行表达测序的目的。10× Genomics的Chromium Single Cell单细胞测序技术的发展，极大地促进了单细胞组学研究。

技术特点：

·  超高的捕获效率（单个细胞捕获效率65%）

·  全自动真正单细胞分离、实验周期短

·  超高的细胞通量（每个样本最多可测10000个细胞）

·  超低的单个细胞价格

·  通量高（可同时检测8个样本）

应用层面：

·  单细胞转录组：单细胞转录组测序使人们能够对异质群体中的细胞亚群进行全面的研究，追踪单个细胞的表达谱，鉴定稀有细胞类型。有效地解决组织样本无法破解的细胞异质性难题。

·  单细胞基因组（CNV)：单细胞基因组测序能够检测单细胞水平的CNV，适合肿瘤研究。

· 单细胞免疫组库：单细胞免疫组库测序解决了TCR/BCR双链匹配的问题，可以在单细胞水平完美匹配TCR/BCR双链。

· 单细胞ATAC-seq：在单细胞层面利用改造后活性极高的转座酶切割开放染色质区域，对此区域进行测序，是转录调控机制研究领域的一种高效、简便的方法。

样本准备要求：

·  细胞数量与浓度：细胞起始数量大于1x10⁵；浓度 5x10⁵-1.2x10⁶ /ml；

·  细胞活性：活细胞数量在90%以上；

·  细胞大小：细胞直径小于40 μm；

·  组织需要解离成单细胞悬液；

· 植物细胞需要制成原生质体；

·  细胞培养基及缓冲液不能含有Ca²⁺和Mg²⁺等影响酶活性的物质。

单位介绍

• 上海生物芯片有限公司（SBC）成立于2001年。2003年国家发改委批复，依托SBC设立生物芯片上海国家工程研究中心，总投资2.9亿。该中心是我国生物医药领域规模最大的生物技术国家工程研究中心之一，致力于生物芯片及相关生物技术在生命科学研究、医疗保健和药物开发等领域的应用和推广，是全国生物样本标准化技术委员会（TC559）、中国医药生物技术协会组织生物样本库分会（BBCMBA）与中国抗癌协会肿瘤样本整合研究分会的秘书处与主任委员单位。 公司（中心）成立以来，始终秉承公司发展愿景和国家工程研究中心的战略使命，坚持“科研创新、市场导向、以人为本”的价值理念，充分发挥国家工程中心的品牌优势、平台优势、人才优势，确立了以生物样本资源库、基因芯片、高通量测序、组织芯片和生物信息学为核心平台的技术创新服务体系，以分子医学检验和分子诊断产品研发生产为核心竞争力的产业化体系，形成科研和药物研发技术服务、分子检验服务和分子诊断产品研发生产销售等三大主营业务，成为张江高科技园区生物医药产业基地一个具有行业影响力和发展特色的创新创业企业集群。

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