芯片推荐：Genome-Wide Human SNP Array 6.0
芯片介绍：Affymetrix Genome-Wide Human SNP 6.0芯片产品涵盖超过1,800,000个遗传变异标志物：包括超过906,600个SNP和超过946,000个用于检测拷贝数变化（CNV, Copy Number Variation）的探针:

• 482,000个SNP来自于前代产品500K和SNP5.0芯片；
• 424,000个SNP包括国际HapMap计划中的标签SNP，X，Y染色体和线粒体上具有代表性的SNP,以及来自于重组热点区域和500K芯片设计完成后新加入dbSNP数据库的SNP；
• 202,000个用于检测5,677个已知拷贝数变异区域的探针，这些区域来源于多基因组变异体数据库。该数据库中3,182个非重叠片断区域平均用61个探针来检测；
• 744,000个探针平均分配到整个基因组上，用来发现未知的拷贝数变异区域。

Affymetrix SNP6.0 芯片物理覆盖度

芯片推荐：Affymetrix Mouse Diversity Genotyping Array

芯片介绍：这款芯片与Human SNP 6.0 芯片类似，既包含SNP探针，也包含CNV探针。一共涵盖623,000个SNP和916,000个CNV位点。

SBC也可为您提供以下物种的Affymetrix SNP芯片服务：犬、稻、生菜、胡椒、拟南芥、玫瑰、草莓、鳟鱼

基于GeneTitan平台的Axiom基因分型芯片
Affymetrix Axiom平台支持全基因组关联和候选基因关联相关研究。研究者将不再受困于固定内容的芯片，全新的基因分型平台采用酶介导、单碱基测序步骤来确保实验的低成本、分型结果的高重复性和流程的全自动化。该产品参照HapMap和千人基因组计划(1KGP)数据库设计探针，与GeneTitanTM配套使用。

芯片推荐：Axiom® Biobank Genotyping Arrays
芯片介绍：能经济地对大样品集合进行基因分型，如生物样本库、基因组中心及核心实验室筛查的样品。芯片有目录版本和定制版本可供选择。

• 功能强大、适合主要人类族群的高覆盖度分析的全基因组关联研究（GWAS）分型模块；
• 适合外显子组分析Axiom® Exome外显子分型模块；
•  吸收、分布、代谢和排泄(absorption, distribution, metabolism, and excretion ,ADME)及其他临床相关的标记；
•  新发现的功能丧失变异，包括最近外显子组测序项目中发现的序列插入和缺失。

芯片推荐：Axiom® miRNA Target Site Genotyping Arrays
芯片介绍：一款人类全基因组范围评估miRNA靶基因位点的高密度基因分型工具。该芯片可检测在miRNA级联放大反应中影响基因功能的238,000个SNP和插入缺失位点，包括miRNA、它们的mRNA靶基因位点以及沉默机制相关的位点。其中80%的位点是在其他相关基因分型芯片上所没有的。因此也可以用它来补充一些GWAS研究和基因调控相关的研究

芯片推荐：Axiom® Genome-Wide Population-Optimized Human Arrays
芯片介绍：最大限度覆盖不同人种的稀有和常见变异，关注与疾病密切相关以及功能相关的SNP，包含Axiom®中国人基因分型芯片(CHB 1和CHB 2)。

芯片推荐：人 Axiom® Exome Genotyping Arrays
芯片介绍：最完整的外显子组基因分型芯片，可筛查功能变异，有助于更好的发现新的人类编码区SNP以及插入缺失。

芯片推荐：牛 Axiom® Genome-Wide BOS 1 Bovine Array
芯片介绍：此款芯片是与牛基因分型领域的重要科学家合作开发的，实现了准确的遗传价值评估、全基因组关联研究(GWAS)、生物多样性和连锁不平衡（LD）研究。此芯片旨在最大限度提高Bos taurus和Bos indicus品种的遗传和物理SNP覆盖度。芯片超过640,000个SNP标记，代表了来自Affymetrix牛基因组数据库的大约300万个SNP的遗传多样性。

芯片推荐：水牛 Axiom® Buffalo Genotyping Array
芯片介绍：Axiom® Buffalo Genotyping Array带来了多个物种和品系的水牛（Bubalus bubalis bubalis和Bubalus bubalis carabanensis）中多态性SNP的最高全基因组范围覆盖，这些水牛是意大利、巴西和南亚最重要的肉牛和奶牛之一。此芯片是目前市场上唯一一款高密度的水牛基因分型工具，含有90,000个常见和稀有标记。。

芯片推荐：鸡 Axiom® Genome-Wide Chicken Genotyping Array
芯片介绍：此芯片是第一款商业化的高密度鸡基因分型芯片。此芯片包含580,000常见和稀有的变异标记，这些标记存在于商业的蛋鸡和肉鸡以及非商业的远交群中。它适用于蛋鸡和肉鸡的基因组选择研究、全基因组关联研究、高分辨率遗传图谱、孟德尔性状作图及选择进化研究。

芯片推荐：玉米 Axiom® Maize Genotyping Array
芯片介绍：玉米是一个二倍体物种（n=10），其基因组大小为2.5Gb。不同品种的玉米基因组表现出重复DNA和高的基因组与结构多样性。玉米还表现出50-300bp的极低连锁不平衡（LD），从而需要非常高密度的芯片来研究单倍型结构和基因组多样性。Axiom Maize Genotyping Array带来了极高密度的（600K）全基因组SNP覆盖。这些多态性SNP在285个硬粒型（Flint）和马齿型（Dent）玉米中检测到，代表了161个来自世界各地的不同品种。

芯片推荐：三文鱼 Axiom® Salmon Genotyping Array
芯片介绍：此款芯片由Affymetrix联合苏格兰的科学家共同开发，包含130,000个SNP标记。芯片上的高密度标记确保了三文鱼基因组的广泛覆盖，又避免了重要区域的代表性不足。此芯片适用于三文鱼复杂性状研究、分子育种、选择进化研究。

芯片推荐：大豆 Axiom® Soybean Genotyping Array
芯片介绍：此款芯片也称为Axiom® SoyaSNP 96-Array Plate，共包括180,961个标记，适用于对栽培和野生的大豆品种进行基因分型。它是全基因组关联研究和高密度遗传作图的理想选择，可确定野生及栽培大豆种质中的重要适应性基因。

芯片推荐：小麦 Axiom Wheat HD Genotyping Array &Breeder’s Genotyping Array
芯片介绍：小麦的基因分型芯片是通过Affymetrix专家设计项目与英国布里斯托大学合同设计的。芯片有两种：高密度（HD）的芯片包含817,000个SNP位点，而Breeder’s基因分型芯片包含35,000个SNP位点。这些芯片上的标记都可以在CerealsDB网站（http://www.cerealsdb.uk.net/）上查询。

SBC也可协助研究者根据实验需求，定制Axiom® myDesign™ Genotyping Arrays。 

服务相关(以Affymetrix SNP6.0芯片为例)

样品要求

1.样品纯度：OD 260/280值应在1.7～2.0 之间, A260/A230 > 1.5；RNA 应该去除干净；不含有其它个体或其它物种的DNA污染。
2.样品浓度：浓度不低于55ng/µl；
3.样品总量：每个样品总量不少于2µg 。
4样品溶剂：溶解在Reduced TE (10mM Tris, pH 8,0，0.1mM EDTA)中。
5.样品运输： DNA低温运输（-20℃）；在运输过程中请用parafilm将管口密封好，以防出现污染；

服务流程

数据分析

单位介绍

•        上海伯豪生物技术有限公司（Shanghai Biotechnology Corporation）是上海生物芯片有限公司/生物芯片上海国家工程研究中心根据国内外研发外包发展的需要，整合旗下系统技术平台、商业化服务体系、高素质服务团队等资源成立的致力于研发外包服务的专业化公司。

  上海伯豪生物技术有限公司拥有六大服务平台：生物样品分析平台、微阵列芯片平台、新一代测序平台、生物标志物平台、分子检测平台、生物信息平台，凭借高标准的技术平台和多样化的服务等竞争优势，公司向国内外企业和相关单位提供系统的生物学研究全面解决方案。目前正在为多达18家跨国制药企业（包括排名前10位的跨国制药企业）和超过3000家的国内科研机构、医院等提供基因表达谱、基因分型、比较基因组学、DNA甲基化、miRNA、生物标志物筛选及确认、生物信息等技术服务。 

  公司拥有一支以上海为基础，辐射全国的强大市场营销队伍和销售网络，已设立华北、华南、华东三个大区十五个办事处，推广公司的主导技术服务、代理产品，快速提升公司品牌的知名度，扩大影响力。过去10年承接项目数超过10000个，用户单位3000家以上，协助客户发表SCI论文700余篇（影响因子共计3000多分），全面推动了中国基因组学服务产业的发展。 

  公司建立了规模化的质量控制体系，通过了ISO9001: 2008质量技术体系的认证，并参照GLP-L的标准，通过128个SOP文件对项目、样品、实验过程、生物信息分析过程、数据信息管理、保密等进行严格质控。尤其是数据管理，做到异地备份，保密管理。为用户的数据真实性、可靠性提供了保证。

  公司的系统化技术平台和高质量的服务体系得到了广大客户认可和合作伙伴的高度评价。公司平台陆续获得了国际知名高通量技术厂商Illumina、Affymetrix、Agilent、ABI的技术服务中心认证。公司于2012年获得诺华（CNIBR）优秀供应商奖（Supplier Award 2012）。公司是Affymetrix公司在中国第一家认证的服务提供商，是Agilent公司在国内唯一认证的服务提供商，先后被授予“Agilent公司亚太区最佳服务供应商”和“Affymetrix公司优秀服务商”称号。

  
  

单位资质

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